1. Manajemen Perubahan
   Target yang ingin dicapai melalui program ini adalah:
   1. meningkatnya komitmen pimpinan dan pegawai Inspektorat Jenderal dalam melakukan reformasi birokrasi;
   2. terjadinya perubahan pola pikir dan budaya kerja Inspektorat Jenderal;
   3. menurunnya risiko kegagalan yang disebabkan kemungkinan timbulnya resistensi terhadap perubahan.
2. Penataan Peraturan Perundang-undangan
   Target yang ingin dicapai melalui program ini adalah:
   1. menurunnya tumpang tindih dan disharmonisasi peraturan perundang-undangan yang dikeluarkan oleh Inspektorat Jenderal;
   2. meningkatnya efektivitas pengelolaan peraturan perundang-undangan Inspektorat Jenderal.
3. Penataan dan Penguatan Organisasi
   Target yang ingin dicapai melalui program ini adalah:
   1. menurunnya tumpang tindih tugas pokok dan fungsi internal Inspektorat Jenderal;
   2. meningkatnya kapasitas Inspektorat Jenderal dalam melaksanakan tugas pokok dan fungsi.
4. Penataan Tatalaksana
   Target yang ingin dicapai melalui program ini adalah:
   1. meningkatnya penggunaan teknologi informasi dalam proses penyelenggaraan manajemen pemerintahan di lingkungan Inspektorat Jenderal;
   2. meningkatnya efisiensi dan efektivitas proses manajemen pemerintahan di lingkungan Inspektorat Jenderal;
   3. meningkatnya kinerja di lingkungan Inspektorat Jenderal.
5. Penataan Sistem Manajemen SDM Aparatur
   Target yang ingin dicapai melalui program ini adalah:
   1. meningkatnya ketaatan terhadap pengelolaan SDM aparatur di lingkungan Inspektorat Jenderal;
   2. meningkatnya transparansi dan akuntabilitas pengelolaan SDM aparatur di lingkungan Inspektorat Jenderal;
   3. meningkatnya disiplin SDM aparatur di lingkungan Inspektorat Jenderal;
   4. meningkatnya efektivitas manajemen SDM aparatur di lingkungan Inspektorat Jenderal;
   5. meningkatnya profesionalisme SDM aparatur di lingkungan Inspektorat Jenderal.
6. Penguatan Pengawasan
   Target yang ingin dicapai melalui program ini adalah:
   1. meningkatnya kepatuhan terhadap pengelolaan keuangan negara oleh Inspektorat Jenderal dan Kementerian Perhubungan;
   2. meningkatnya efektivitas pengelolaan keuangan negara di lingkungan Inspektorat Jenderal dan Kementerian Perhubungan;
   3. meningkatnya status opini BPK terhadap pengelolaan keuangan negara Kementerian Perhubungan;
   4. menurunnya tingkat penyalahgunaan wewenang di lingkungan Inspektorat Jenderal dan Kementerian Perhubungan.
7. Penguatan Akuntabilitas Kinerja
   Target yang ingin dicapai melalui program ini adalah:
   1. meningkatnya kinerja Inspektorat Jenderal; dan
   2. meningkatnya akuntabilitas Inspektorat Jenderal.
8. Peningkatan Kualitas Pelayanan Publik
   Target yang ingin dicapai melalui program ini adalah meningkatnya kualitas pelayanan publik yang dikelola oleh Inspektorat Jenderal.